kolegij: STRUKTURA GENA I NJIHOVA TRANSKRIPCIJA
voditelj kolegija: prof. dr. sc. Biserka Nagy, doc. dr. sc. Igor Štagljar
Kratki sadržaj:
I. Genska struktura i transkripcija u eukariota
Struktura i organizacija eukariotskog genoma: opća obilježja, prva grupa gena, druga grupa gena, treća grupa gena, struktura kromatina i nuklearnog matriksa. Transkripcija u eukariota: raznolikost djelovanja RNA polimeraza, struktura i funkcija nuklearnih RNA polimeraza. Transkripcijski model in vitro za eukariote: opća obilježja, transkripcija putem RNA polimeraze I, transkripcija putem RNA polimeraze II, transkripcija putem RNA polimeraze III. Sazrijevanje RNA molekula u eukariota.
II. Regulacija transkripcije u eukariota
Regulacija prve grupe rRNA gena: opća obilježja, mehanizam regulacije transkripcije rRNA gena. Regulacija druge grupe gena: trranskripcijski faktori u nižih eukariota, transkripcijski faktori u viših eukariota, alternativne promocije, sazrijevanja i poliadenilacije. Regulacije treće grupe gena: oogeneza i embriogeneza u vrsti Xenopus, alternativni putevi regulacije III grupe gena. Globalna genska kontrola: opća obilježja, struktura kromatina i metilacija. Eukariotski transkripcijski faktori: oblici i funkcije, podjela eukariotskih transkripcijskih faktora, način djelovanja transkripcijskih faktora.
Izbor literature:
Agabian, N., Trans-splicing of nuclear pre-mRNAs. Cell, 61, 1157-1160, 1990.
Dynan, W. S., Promotor housekeeping genes. Trend Genet. 2, 196, 1990.
Sharpe, P. A., Gene transcription. Nature, 356, 16-18, 1991.
Grundstein, M., Nucleosomes: regulators of transcription. Trends Genet. 6, 395-400, 1990.
Latchman, D., Gene regulation: an eucaryotic prospective. Unwin Hyman, London, 1990.
McKnight, S. L., Molecular zippers in gene regulation. Sci. Am., April, pp 32-39, 1991.
PMF, Zagreb, 2004