kolegij:
RA?UNALSKI PRAKTIKUM
voditelj kolegija: doc. dr.
sc. Kristian Vlahoviček
Kratki sadroaj:
Svrha
kolegija je uputiti polaznike u metode računalne biologije i analize
biolou^ke informacije. Program: Uvod u bioinformatiku. Biolou^ke baze
podataka, arhitektura i pretraoivanje. Algoritmi sravnjenja sljedova.
Mnogostruko sravnjenje sljedova. Filogenija, evolucijske analize
sljedova. Predviđanje sekundarne strukture proteina. Predviđanje gena.
Klasifikacija proteina i predviđanje prostorne strukture (molekulsko
modeliranje). Genomske analize.
Izbor literature:
"Bioinformatics:
sequence and genome analysis" D. W. Mount (2001), Cold spring harbor
laboratory press, Cold spring harbor, New York
"Bioinformatics: the
machine learning approach" P. Baldi and S.Brunak (2001), MIT press,
Cambridge o?N Massachusets, London o?N England
"Biological sequence
analysis: probabilistic models of proteins and nucleic acids" R.
Durbin, S.Eddy, A. Krogh and G.Mitchison (1998), Cambridge university
press, Cambridge, England